预计2016年小麦病虫害总体偏重发生，发生面积9.7亿亩次。其中，虫害4.9亿亩次、病害4.8亿亩次。赤霉病在长江中下游和黄淮麦区大流行风险高，纹枯病、白粉病的，发病率比较高。

赤霉病发生面积1亿亩。其中，湖北东部和江汉平原、安徽沿淮及其以南、江苏沿江和苏南、浙江北部、上海沿海麦区有大流行的风险，长江中下游其他麦区、黄淮麦区有偏重流行的可能，华北和西南等麦区有中等流行的可能。条锈病发生面积约3700万亩。

纹枯病发生面积1.1亿亩。其中，湖北东部和江汉平原、安徽和江苏的淮北和沿淮、沿江麦区，以及河南偏重发生，江淮、黄淮、华北的其他麦区中等发生，西南、西北麦区偏轻或轻发生。叶锈病发生面积5000万亩，黄淮、江淮和华北南部偏重发生。叶枯病、根腐病、全蚀病、黑穗病、胞囊线虫病、病毒病在部分麦区会造成一定危害。

其中，河南西部、山东中南部、山西南部等地偏重发生，华北、黄淮、西北大部麦区中等发生，江淮、西南大部麦区偏轻或轻发生。吸浆虫发生面积约3000万亩。其中，河北中南部、陕西关中中东部、河南北部及南阳、天津中等发生，华北、黄淮和西北其他麦区偏轻发生。金针虫、蛴螬、蝼蛄等地下害虫发生面积6000万亩。

条锈病秋苗发生面积小、总体病情偏轻。甘肃、宁夏、青海、陕西等西北秋苗主发区发生面积216万亩，是2001年以来最小的一年，各地多以单片病叶为主，局部早播麦田发病中心多。甘肃见病面积170.5万亩，同比减少12.0%，平均病田率15%-50%，平均病叶率0.01%-6.5%，最高达20%-30%。宁夏见病面积为20.4万亩，同比减少56.8%，最高病叶率30%。青海秋苗见病面积为2.5万亩。陕西陇县2015年11月2日见病，比2014年晚8天，仍属偏早发生年份，平均病田率5.8%。四川剑阁于2015年11月16日始见，比2014年早3天，属于早发年份。

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